对于不同的缺陷，应采取不同的解决办法。充分利用有缺陷的木材，是节约木材的重要环节。木材又是重要的森林资源，应该想方设法合理利用木材，充分发挥木材的最大经济效益。实践证明，有缺陷的木材不仅能够用，有时还能够创造更大的经济价值。
枝丫和节子是比较普遍的缺陷。如果遇到节子多的木材，可以用作承受压力的构件，因为节子对于这些用材没有什么影响。在制材中尽量把节子集中在少数板方材上，如果是活节，多锯为枕木。在使用横梁时，如节子在中间，应把有节子的一面，放在上面，避免留在受弯部位，因为上面受压缩应力，对强度影响不大。死节应予剔除，有些树种可以利用健全节、树丫刨切成薄木，用于制造家具或其他细木工制品。
腐朽是木材最严重的缺陷，腐朽的木材原则上不应使用，但是可根据腐朽程度和不同情况，把它加工利用，成为有用之材。例如在腐朽初期的色木，由于菌类引起变色的条纹或斑点，进行热压处理，成为压缩木，呈现出大理石一样的花纹，用于制造各种用品，花纹美观。还有利用白色腐朽菌侵蚀木素，只剩下纤维素的特点，把这些初期腐朽的木材，用于造纸或化学纤维。
裂纹严重的木材也应避免使用，表面虫沟、小虫眼，除影响美观外，在使用上一般影响不大。至于树干形状的缺陷，主要是影响木材的出材率。弯曲的原木，必须尽量裁成短料，以便合理利用。也有专用弯曲材的，如造船对弯曲材不加限制，反而利用它的弯曲，如护栏木。
大兜、根茎和斜纹木材，不易劈开，把它们刨切成薄木，却会有很美丽的花纹，可以镶饰各种木制品，是木材加工上极有价值的材料。
树瘤或叫树包，它是树木生长时，长在树干上的“瘤子”。木材纹理错综，形成美丽的花纹，并有特殊的强度和硬度、不开裂、不湿胀、不翘曲。常见于桦木、水青冈、核桃、榆木、槭树等树种。如核桃树瘤经切制成薄木，用于制造高级装饰用胶合板。近代在家具、乐器、胶合板和其他美术工艺用材上，虽有塑料贴面花纹的出现，但对树瘤薄木的要求还是不断增长，因为树瘤薄木花纹经久耐用，永不褪色，所以它一直被视为美术工艺的珍贵材料。这样的木材在自然界的数量有限，需要量又逐渐增加，于是就有人工培育树瘤的方法出现。
明子是大量松脂渗入木质而形成，常发生于树干的局部材质，或经采伐后的松树根株。松树年龄越老，直径越大，根株的树脂也越多，一般认为树脂漏（明子）影响材质，在家具生产中影响油漆，或渗出油脂染污。树脂漏是不正常沉积物，是工程材料性能与选用木材缺陷之一。但是，它不仅是制取松香、松节油的原料，也是烧制松烟的好材料。
此外，还有把带有缺陷的木材，完全打碎成木片，胶压成碎料板，或经打碎磨浆制成纤维板，或经水解制成酒精，或经干馏得到其他化学药品。总之，有些缺陷的木材，在某一条件下利用受到限制，而在另一条件下利用价值却很高，象树瘤、明子等就是这样。