引言
消毒法、清洁法一直是防控传染病的两种有力手段。
1.消毒清洁
消毒和清洁以消灭病毒为目的，如果说清洁法是抵御病毒侵入的消极的预防手段，那么消毒法就是用积极的手段将病毒消灭。
日本最初对消毒方法进行规范并实际应用是在年，该年8月27日发布的内务省乙第79号《霍乱预防心得》中规定应对霍乱患者接触过的物品、场所及排泄物进行消毒，以防止病毒扩散。
在附册《预防法附录消毒药及其使用方法》中，虽尚未认识到霍乱的病因及其传播原理。
但已确认病毒常出现在患者的吐泻物中，随着排泄物增殖传播，并通过厕所、下水道等不洁之处迅速蔓延，而病毒侵入人体主要通过饮用水、食物等，人体、器具也常常成为病毒传播的中介。
借鉴欧洲各国的经验发现，消毒法可以有效地扑灭病毒，如果官民上下认真贯彻执行，不仅可以防止其蔓延，而且能够永远根除该地域的病根。
因此消毒药被广泛运用于人体消毒、物品消毒和环境消毒中。
（1）消毒药的种类及使用方法
消毒药的种类多样，在当时，应对霍乱病的最常见选择是石炭酸。
以石炭酸为原料可制成多种消毒药方，如粗制石炭酸、石炭酸末、结晶石炭酸、石炭酸水、石炭酸溶液、石炭酸蒸气等。
这些加工品被广泛运用在防疫活动中，其结果是市场上的石炭酸变得严重短缺，连官府也十分苦恼，紧急向英国订购原料。
为解燃眉之急，年10月10日发行的内务省卫生局年报第10号中，东京大学医学部的化学教师介绍了除石炭酸及硫酸铁外，可以作为消毒剂的化学物质，如明矾、木炭末、石灰、盐化亚铅等，并详细说明它们的性状和使用方法。
年5月6日，内务省令第1号发布《传染病预防法》的第6条对消毒法的实施方法进行了具体规定：
“消毒方法有焚烧、蒸汽消毒、煮沸消毒、药物消毒四种，其中焚烧适用于传染病患者或尸体使用过的衣物、寝具、布片、便器及其他器具等被病毒严重污染。
消毒后无法回收利用的物品，传染病患者的吐泻物及其它排泄物，垃圾及动物尸体等；
蒸汽消毒适用衣物、寝具、布片等一切绢布、棉布、麻布、毛织品，玻璃器具、陶器、瓷器及其他金属制品或木制品等可被蒸汽加热的物品，使用蒸汽消毒时应注意不损坏物品及安全操作；
煮沸消毒与蒸汽消毒类似，要注意将物品全部浸入水中，在水沸腾后持续煮沸半小时以上；
药物消毒的材料主要是以一定配方配制的石炭酸水，使用时有不同的方法，一是与患者的吐泻物或其它排泄物一比一添加后搅拌；
二是喷洒在器具、室内等地并擦拭；三是在洗净手足后消毒，之后需用清水洗净，四是浸泡衣物六小时以上，其后用清水洗净。”
该条文详细介绍四种不同的消毒方法，并对应各自的适用范围，合适的消毒方法可以有效提高消毒的效率与成功率。
（2）对患者污染物品的消毒
患者的排泄物及随身的污染物品是病毒传播的第一道关卡，因此严格处理这些污染物是防疫活动成功的关键步骤之一。
年霍乱流行时内务省规定患者的排泄物应装入容器中，加入石炭酸后在室外洗净，污水及被污染的衣物等应特殊处理，埋入深坑中并撒上石炭酸末，或直接焚烧掩埋。
东京警视本署发布了关于在家疗养患者排泄物处理的方案，“在人群密集的狭隘场所，霍乱患者的排泄物应尽量装入箱子等容器中，密封后送至指定的排泄物焚烧场，进行焚烧或掩埋。”
但是民众往往难以做到完全规范化处理，并且能够用来掩埋污染物的土地不足。因此警视本署在东京府下指定用来处理霍乱患者排泄物的专用焚烧掩埋场；
令各地依据管辖内患者的人数按比例雇佣工人，驾车在患者家之间巡回，用密封的容器收集患者吐泻物，充分喷洒防臭剂后于夜间搬运至火葬场焚烧，并规定当被污染的布团等需要焚烧的物品过量时可直接送至火葬场焚烧。
同年10月1日，指定的焚烧掩埋场被废弃，此后一律于火葬场焚烧污染物。
对于患者换洗的衣物，需用石炭酸溶液在桶中浸泡一昼夜，再用热水消毒并洗净，洗后还需要用石炭酸蒸汽等熏蒸。
此外，被污染的家具、书籍报纸、器械、食品等都有相应的处理方法。
如果患者不幸死亡，其尸体应被浸泡了石炭酸溶液的木棉包裹，棺内填充大量的石炭酸末，灌注石炭酸溶液，并远离人群。
（）对房屋、船舶、医院的消毒
房屋、船舶、医院作为患者居住、生活、治疗的场所，往往存在病毒传播的危险。
年《霍乱预防心得》首次明确用石炭酸蒸汽或硫磺熏蒸被污染空间的方法，其后《传染病消毒心得书》中进一步介绍说明：
当消毒霍乱患者的卧室及其它被污染的房间时，应先将室内的寝具等消毒后拿出，打扫房间里的垃圾并焚烧，扫除完毕后用石炭酸水等擦拭室内，消毒结束后房间保持阳光照射和空气流通，在室内完全干燥前不得使用。
当消毒霍乱患者所在的船舶时，应先除去患者所处的船室的寝具等杂物，打扫室内各处，并喷洒石炭酸水进行消毒；
随后用水擦洗干净，尽量保持阳光照射和空气流通，室内完全干燥前船客不得进入，其他船室如果有被污染的风险，也应该用水洗净；
在患者使用过的厕所喷洒石炭酸水或石灰乳，之后用水洗净，船只如有被吐泻物浸染的可能，应注入消毒药，排出船底污水后用水洗净，及时更换船中的饮用水，并认真洗净储水器。
同样，依据不同的情况，患者发病时所处的其它场所也应该实行严格的消毒和清洁，明治时期对于旅馆、马车等人员流动密集的场所也有着相应的消毒规定。
（4）对厕所、垃圾场、下水道的消毒
霍乱极易通过污水传播，如果带有病毒的污水混入饮用水或生活用水中，那么疫情将会迅速传播，因此厕所、垃圾场、下水道等不洁之地是最容易聚集病毒的场所。
明治时期对此针对性地采取了不同的消毒方法：厕所每日充分扫除，并撒布绿矾与石炭酸的混合药剂；
垃圾场内撒布石炭酸末或在打扫时浇灌绿矾与石炭酸的混合药剂；下水道每日疏通，用水灌洗干净，如有污物淤积，可倒入石炭酸水消毒。
年9月22日，警视本署发出提醒“虽已通知关于道路、下水道、垃圾场、厕所等一切不洁的场所的扫除事项。
但眼下霍乱有流行的征兆，各地的户主及管理人应特别注意在扫除时必须使用绿矾（硫酸亚铁）进行消毒。”
10月日，警视本署发布《沟渠疏浚心得》，其内容包括从下水道清理出的污泥及垃圾，应尽快搬运到远离居民的地方，或在附近的空旷处掩埋，绝不能堆积放置在下水道旁；
虽然下水道的通畅非常重要，但此时随意的搅动会使恶臭传播，有加速病毒传染的风险，因此即使是不流通的污水滞留处，也应经常喷洒防臭剂；
虽有下水道但没有水路通往河海的场所，应设计草图进行规划。
年的霍乱流行时，警视本署在旅馆、剧场等人群聚集场所的厕所喷洒了防臭剂，对这些场所的消毒有效阻止了霍乱的传播。
年法律第41号《污物扫除法》及内务省令第5号同法施行规则出台，污物清洁有了更为系统的规定。